解:(1)设每轮感染中平均1台电脑会感染$x$台电脑.
由题意,得$1 + x + x(1 + x)=16.$
整理,得$(1 + x)^2 = 16,$
开平方得$1+x=\pm4,$
解得$x_1 = 3,$$x_2 = - 5$(不合题意,舍去).
所以每轮感染中平均1台电脑会感染3台电脑.
(2)机房内的电脑共有$100 + 1 = 101$(台).
$n$轮感染后,有$(1 + x)^n$台电脑被感染,即$(1 + 3)^n = 4^n$(台)电脑被感染.
当$n = 3$时,$4^3 = 64;$当$n = 4$时,$4^4 = 256.$
因为$64\lt101\lt256,$所以4轮感染后机房内的所有电脑将都被感染.