证明:∵四边形$ABCD$是矩形
∴$AB=CD$,$AB//CD$,∴$∠BAE=∠DCF$
$ $又$BE⊥AC$,$DF⊥AC$
∴$∠AEB=∠CFD=90°$
$ $在$△ABE$与$△CDF{中}$
$\begin {cases}{ ∠AEB=∠CFD}\\{ ∠BAE=∠DCF}\\{AB=CD}\end {cases}$
∴$△ABE≌△CDF(\mathrm {AAS})$,∴$AE=CF$
∴$AE+EF=CF+EF$,即$AF=CE$