证明$:(1)$∵将$ABCD$沿过点$A$的直线$l$折叠,
使点$D$落到$AB$边上的点$D′$处,
∴$∠DAE=∠D′AE,∠DEA=∠D′EA,∠D=∠AD′E,$
∵$DE∥AD′,$
∴$∠DEA=∠EAD′,$
∴$∠DAE=∠EAD′=∠DEA=∠D′EA,$
∴$∠DAD′=∠DED′,$
∴四边形$DAD′E$是平行四边形,
∴$DE=AD′,$
∵四边形$ABCD$是平行四边形,
∴$AB∥DC$且$AB=DC,$
∴$CE∥D′B$且$CE=D′B,$
∴四边形$BCED′$是平行四边形.
$(2)$∵$BE$平分$∠ABC,$
∴$∠CBE=∠EBA,$
∵$AD∥BC,$
∴$∠DAB+∠CBA=180°,$
∵$∠DAE=∠BAE,$
∴$∠EAB+∠EBA=90°,$
∴$∠AEB=90°.$