解:$(1)$设第一次购买龙眼$ x $吨, 第二次购买龙眼$ y $吨
由题意, 得$ \{\begin{array}{l}x+y=21\\0.4x+0.3y=7\end{array},$解得$ \{\begin{array}{l}x=7\\y=14\end{array} $
∴第一次购买龙眼$ 7 $吨,第二次购买龙眼$ 14 $吨
$(2) $设把$ m $吨龙眼加工成桂圆肉, 则把$ (21-m) $吨龙眼加工成龙眼干
由题意, 得$ 10 ×0.2m+3 ×0.5(21-m) \geqslant 39, $解得:$ m \geqslant 15$
∴至少需要把$ 15 $吨龙眼加工成桂圆肉