解:如图,等腰三角形$ABC,$过点$A$作$AD⊥BC,$垂足为点$D$
则$BD=DC=\frac 12BC$
①当底边长为$6$时,腰长为$(16-6)÷2=5$
$ AB=5,$$BD=\frac 12BC=3$
∴$AD=\sqrt{AB^2-BD^2}=4$
$ sin B=\frac {AD}{AB}=\frac 45$
②当腰长为$6$时,底边长为$16-6×2=4$
∴$AB=6,$$BD=\frac 12BC=2$
$ AD=\sqrt{AB^2-BD^2}=4\sqrt 2$
$ sin B=\frac {AD}{AB}=\frac {4\sqrt 2}{6}=\frac {2\sqrt 2}3$
综上,底角的正弦值为$\frac 45$或$\frac {2\sqrt 2}3$