$(1)$证明:∵四边形$ABCD$是矩形
∴$∠BAD=∠B=90°$
由翻折可知,$AF⊥DE$
∴$∠BAF+∠FAD=∠FAD+∠ADE=90°$
∴$∠ADE=∠BAF$
∴$△ABF∽△DAE$
$(2)$解:如图,过点$F$作$MN//BC$交$AB$于$M,$交$CD$于$N$

四边形$AMND$是矩形,设$EM=x$
由翻折可知,$AE=EF,$$AD=DF=3$
∵点$E$是$AB$的中点,$AB=2$
∴$AE=EF=1$
∵$∠BAD=∠EFD=90°,$$∠EMF=∠DNF=90°$
∴$∠EFM+∠DFN=90°,$$∠DFN+∠FDN=90°$
∴$∠EFM=∠FDN$
∴$△EFM∽△FDN$
∴$\frac {EM}{FN}=\frac {FM}{DN}=\frac {EF}{FD}=\frac {1}{3}$
∴$FN=3EM=3x,$$FM=3-3x$
在$Rt△EFM$中,$EF=EA=1$
$x^2+(3-3x)^2=1^2$
解得$x_1=1($舍去),$x_2=\frac {4}{5}$
∴$EM=\frac 45,$$FM=\frac {3}{5}$
∵$FM//BC$
∴$△EMF∽△EBG$
∴$\frac {EM}{EB}=\frac {FM}{BG},$即$\frac {\frac {4}{5}}{1}=\frac {\frac {3}{5}}{BF}$
∴$BG=\frac {3}{4}$